Protein–RNA interactions for Protein: Q91VB4

Hps3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,002 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps3Q91VB4 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hps3Q91VB4 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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