Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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