Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM4

Ccdc73, Coiled-coil domain-containing protein 73, mousemouse

Predictions only

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc73Q8CDM4 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc73Q8CDM4 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc73Q8CDM4 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc73Q8CDM4 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc73Q8CDM4 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc73Q8CDM4 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc73Q8CDM4 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc73Q8CDM4 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc73Q8CDM4 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc73Q8CDM4 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc73Q8CDM4 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc73Q8CDM4 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc73Q8CDM4 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc73Q8CDM4 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc73Q8CDM4 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc73Q8CDM4 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc73Q8CDM4 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc73Q8CDM4 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc73Q8CDM4 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc73Q8CDM4 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc73Q8CDM4 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc73Q8CDM4 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc73Q8CDM4 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc73Q8CDM4 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc73Q8CDM4 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc73Q8CDM4 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc73Q8CDM4 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc73Q8CDM4 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc73Q8CDM4 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc73Q8CDM4 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc73Q8CDM4 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc73Q8CDM4 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc73Q8CDM4 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc73Q8CDM4 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc73Q8CDM4 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc73Q8CDM4 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc73Q8CDM4 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc73Q8CDM4 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc73Q8CDM4 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc73Q8CDM4 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc73Q8CDM4 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc73Q8CDM4 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc73Q8CDM4 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc73Q8CDM4 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc73Q8CDM4 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc73Q8CDM4 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc73Q8CDM4 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc73Q8CDM4 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc73Q8CDM4 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc73Q8CDM4 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc73Q8CDM4 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc73Q8CDM4 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc73Q8CDM4 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc73Q8CDM4 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc73Q8CDM4 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc73Q8CDM4 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc73Q8CDM4 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc73Q8CDM4 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc73Q8CDM4 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc73Q8CDM4 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc73Q8CDM4 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc73Q8CDM4 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc73Q8CDM4 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc73Q8CDM4 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc73Q8CDM4 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc73Q8CDM4 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc73Q8CDM4 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc73Q8CDM4 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc73Q8CDM4 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc73Q8CDM4 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc73Q8CDM4 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc73Q8CDM4 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc73Q8CDM4 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc73Q8CDM4 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc73Q8CDM4 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc73Q8CDM4 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc73Q8CDM4 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc73Q8CDM4 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc73Q8CDM4 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms