Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
BC061212Q6P8K3 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
BC061212Q6P8K3 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
BC061212Q6P8K3 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
BC061212Q6P8K3 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
BC061212Q6P8K3 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
BC061212Q6P8K3 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
BC061212Q6P8K3 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
BC061212Q6P8K3 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
BC061212Q6P8K3 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
BC061212Q6P8K3 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
BC061212Q6P8K3 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
BC061212Q6P8K3 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
BC061212Q6P8K3 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
BC061212Q6P8K3 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
BC061212Q6P8K3 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
BC061212Q6P8K3 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
BC061212Q6P8K3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
BC061212Q6P8K3 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
BC061212Q6P8K3 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
BC061212Q6P8K3 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
BC061212Q6P8K3 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
BC061212Q6P8K3 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
BC061212Q6P8K3 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
BC061212Q6P8K3 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
BC061212Q6P8K3 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
BC061212Q6P8K3 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
BC061212Q6P8K3 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
BC061212Q6P8K3 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
BC061212Q6P8K3 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
BC061212Q6P8K3 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
BC061212Q6P8K3 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
BC061212Q6P8K3 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
BC061212Q6P8K3 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
BC061212Q6P8K3 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
BC061212Q6P8K3 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
BC061212Q6P8K3 Tbata-210ENSMUST00000151886 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
BC061212Q6P8K3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
BC061212Q6P8K3 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
BC061212Q6P8K3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
BC061212Q6P8K3 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
BC061212Q6P8K3 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
BC061212Q6P8K3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
BC061212Q6P8K3 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
BC061212Q6P8K3 CT009754.4-201ENSMUST00000221430 565 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
BC061212Q6P8K3 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
BC061212Q6P8K3 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
BC061212Q6P8K3 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
BC061212Q6P8K3 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
BC061212Q6P8K3 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
BC061212Q6P8K3 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
BC061212Q6P8K3 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
BC061212Q6P8K3 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
BC061212Q6P8K3 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
BC061212Q6P8K3 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
BC061212Q6P8K3 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
BC061212Q6P8K3 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
BC061212Q6P8K3 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
BC061212Q6P8K3 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
BC061212Q6P8K3 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
BC061212Q6P8K3 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
BC061212Q6P8K3 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
BC061212Q6P8K3 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
BC061212Q6P8K3 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
BC061212Q6P8K3 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
BC061212Q6P8K3 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
BC061212Q6P8K3 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
BC061212Q6P8K3 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
BC061212Q6P8K3 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
BC061212Q6P8K3 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
BC061212Q6P8K3 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
BC061212Q6P8K3 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
BC061212Q6P8K3 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
BC061212Q6P8K3 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
BC061212Q6P8K3 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
BC061212Q6P8K3 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
BC061212Q6P8K3 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
BC061212Q6P8K3 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
BC061212Q6P8K3 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
BC061212Q6P8K3 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
BC061212Q6P8K3 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
BC061212Q6P8K3 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
BC061212Q6P8K3 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
BC061212Q6P8K3 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
BC061212Q6P8K3 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
BC061212Q6P8K3 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
BC061212Q6P8K3 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
BC061212Q6P8K3 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
BC061212Q6P8K3 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
BC061212Q6P8K3 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
BC061212Q6P8K3 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
BC061212Q6P8K3 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
BC061212Q6P8K3 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
BC061212Q6P8K3 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
BC061212Q6P8K3 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
BC061212Q6P8K3 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
BC061212Q6P8K3 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
BC061212Q6P8K3 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
BC061212Q6P8K3 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
BC061212Q6P8K3 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms