Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim24Q64127 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms