Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sall3Q62255 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sall3Q62255 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sall3Q62255 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sall3Q62255 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sall3Q62255 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sall3Q62255 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sall3Q62255 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sall3Q62255 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sall3Q62255 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sall3Q62255 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sall3Q62255 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sall3Q62255 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sall3Q62255 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sall3Q62255 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sall3Q62255 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sall3Q62255 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sall3Q62255 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sall3Q62255 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sall3Q62255 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sall3Q62255 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sall3Q62255 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sall3Q62255 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sall3Q62255 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Sall3Q62255 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Sall3Q62255 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sall3Q62255 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Sall3Q62255 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sall3Q62255 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Sall3Q62255 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Sall3Q62255 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sall3Q62255 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Sall3Q62255 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sall3Q62255 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Sall3Q62255 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sall3Q62255 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Sall3Q62255 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sall3Q62255 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Sall3Q62255 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sall3Q62255 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Sall3Q62255 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Sall3Q62255 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sall3Q62255 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Sall3Q62255 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Sall3Q62255 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Sall3Q62255 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Sall3Q62255 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Sall3Q62255 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sall3Q62255 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Sall3Q62255 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sall3Q62255 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sall3Q62255 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sall3Q62255 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sall3Q62255 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sall3Q62255 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sall3Q62255 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sall3Q62255 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sall3Q62255 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sall3Q62255 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sall3Q62255 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sall3Q62255 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Sall3Q62255 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Sall3Q62255 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sall3Q62255 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sall3Q62255 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sall3Q62255 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sall3Q62255 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sall3Q62255 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sall3Q62255 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sall3Q62255 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sall3Q62255 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sall3Q62255 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sall3Q62255 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sall3Q62255 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sall3Q62255 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sall3Q62255 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sall3Q62255 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sall3Q62255 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sall3Q62255 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sall3Q62255 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sall3Q62255 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sall3Q62255 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sall3Q62255 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sall3Q62255 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sall3Q62255 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Sall3Q62255 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Sall3Q62255 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sall3Q62255 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Sall3Q62255 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sall3Q62255 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sall3Q62255 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sall3Q62255 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sall3Q62255 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sall3Q62255 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sall3Q62255 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sall3Q62255 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sall3Q62255 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sall3Q62255 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sall3Q62255 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sall3Q62255 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms