Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
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Cln3Q61124 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Cln3Q61124 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Cln3Q61124 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Cln3Q61124 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
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Cln3Q61124 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Cln3Q61124 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Cln3Q61124 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Cln3Q61124 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Cln3Q61124 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Cln3Q61124 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Cln3Q61124 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Cln3Q61124 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cln3Q61124 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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