Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prdm1Q60636 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms