Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

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Length 539 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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