Protein–RNA interactions for Protein: Q3THW5

H2afv, Histone H2A.V, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afvQ3THW5 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2afvQ3THW5 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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