Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Treml4Q3LRV9 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Treml4Q3LRV9 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Treml4Q3LRV9 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Treml4Q3LRV9 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Treml4Q3LRV9 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Treml4Q3LRV9 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Treml4Q3LRV9 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Treml4Q3LRV9 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Treml4Q3LRV9 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Treml4Q3LRV9 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Treml4Q3LRV9 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Treml4Q3LRV9 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Treml4Q3LRV9 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Treml4Q3LRV9 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Treml4Q3LRV9 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Treml4Q3LRV9 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Treml4Q3LRV9 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Treml4Q3LRV9 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Treml4Q3LRV9 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Treml4Q3LRV9 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Treml4Q3LRV9 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Treml4Q3LRV9 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Treml4Q3LRV9 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Treml4Q3LRV9 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Treml4Q3LRV9 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Treml4Q3LRV9 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Treml4Q3LRV9 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Treml4Q3LRV9 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Treml4Q3LRV9 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Treml4Q3LRV9 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Treml4Q3LRV9 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Treml4Q3LRV9 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Treml4Q3LRV9 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Treml4Q3LRV9 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Treml4Q3LRV9 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Treml4Q3LRV9 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Treml4Q3LRV9 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Treml4Q3LRV9 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Treml4Q3LRV9 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Treml4Q3LRV9 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Treml4Q3LRV9 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Treml4Q3LRV9 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Treml4Q3LRV9 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Treml4Q3LRV9 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Treml4Q3LRV9 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Treml4Q3LRV9 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Treml4Q3LRV9 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Treml4Q3LRV9 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Treml4Q3LRV9 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Treml4Q3LRV9 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Treml4Q3LRV9 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Treml4Q3LRV9 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Treml4Q3LRV9 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Treml4Q3LRV9 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Treml4Q3LRV9 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Treml4Q3LRV9 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Treml4Q3LRV9 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Treml4Q3LRV9 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Treml4Q3LRV9 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Treml4Q3LRV9 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Treml4Q3LRV9 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Treml4Q3LRV9 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Treml4Q3LRV9 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Treml4Q3LRV9 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Treml4Q3LRV9 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Treml4Q3LRV9 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Treml4Q3LRV9 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Treml4Q3LRV9 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Treml4Q3LRV9 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Treml4Q3LRV9 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Treml4Q3LRV9 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Treml4Q3LRV9 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Treml4Q3LRV9 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Treml4Q3LRV9 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Treml4Q3LRV9 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Treml4Q3LRV9 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Treml4Q3LRV9 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Treml4Q3LRV9 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Treml4Q3LRV9 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Treml4Q3LRV9 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Treml4Q3LRV9 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Treml4Q3LRV9 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Treml4Q3LRV9 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Treml4Q3LRV9 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Treml4Q3LRV9 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Treml4Q3LRV9 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Treml4Q3LRV9 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Treml4Q3LRV9 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Treml4Q3LRV9 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Treml4Q3LRV9 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Treml4Q3LRV9 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Treml4Q3LRV9 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Treml4Q3LRV9 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Treml4Q3LRV9 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Treml4Q3LRV9 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Treml4Q3LRV9 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Treml4Q3LRV9 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Treml4Q3LRV9 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Treml4Q3LRV9 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
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