Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Cnn1Q08091 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Cnn1Q08091 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms