Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gli1P47806 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gli1P47806 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gli1P47806 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gli1P47806 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gli1P47806 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gli1P47806 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gli1P47806 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gli1P47806 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gli1P47806 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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