Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lig1P37913 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lig1P37913 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lig1P37913 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lig1P37913 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lig1P37913 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lig1P37913 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lig1P37913 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lig1P37913 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lig1P37913 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lig1P37913 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lig1P37913 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lig1P37913 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lig1P37913 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.1 ms