Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Apoc1P34928 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Apoc1P34928 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Apoc1P34928 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Apoc1P34928 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Apoc1P34928 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Apoc1P34928 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Apoc1P34928 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Apoc1P34928 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Apoc1P34928 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Apoc1P34928 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Apoc1P34928 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Apoc1P34928 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Apoc1P34928 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Apoc1P34928 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Apoc1P34928 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Apoc1P34928 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Apoc1P34928 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Apoc1P34928 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Apoc1P34928 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Apoc1P34928 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Apoc1P34928 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Apoc1P34928 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Apoc1P34928 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Apoc1P34928 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Apoc1P34928 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Apoc1P34928 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Apoc1P34928 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Apoc1P34928 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Apoc1P34928 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Apoc1P34928 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Apoc1P34928 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Apoc1P34928 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Apoc1P34928 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Apoc1P34928 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Apoc1P34928 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Apoc1P34928 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Apoc1P34928 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Apoc1P34928 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Apoc1P34928 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Apoc1P34928 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Apoc1P34928 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Apoc1P34928 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Apoc1P34928 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Apoc1P34928 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Apoc1P34928 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Apoc1P34928 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Apoc1P34928 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Apoc1P34928 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Apoc1P34928 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms