Protein–RNA interactions for Protein: P28028

Braf, Serine/threonine-protein kinase B-raf, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrafP28028 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BrafP28028 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BrafP28028 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BrafP28028 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BrafP28028 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BrafP28028 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BrafP28028 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BrafP28028 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BrafP28028 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BrafP28028 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BrafP28028 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
BrafP28028 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BrafP28028 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BrafP28028 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BrafP28028 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
BrafP28028 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BrafP28028 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BrafP28028 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BrafP28028 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BrafP28028 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BrafP28028 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BrafP28028 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BrafP28028 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BrafP28028 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BrafP28028 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BrafP28028 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BrafP28028 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BrafP28028 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BrafP28028 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BrafP28028 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BrafP28028 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BrafP28028 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BrafP28028 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BrafP28028 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BrafP28028 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BrafP28028 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BrafP28028 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BrafP28028 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BrafP28028 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BrafP28028 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BrafP28028 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BrafP28028 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BrafP28028 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BrafP28028 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BrafP28028 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BrafP28028 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BrafP28028 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BrafP28028 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BrafP28028 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BrafP28028 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BrafP28028 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BrafP28028 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BrafP28028 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BrafP28028 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
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BrafP28028 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BrafP28028 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BrafP28028 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
BrafP28028 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
BrafP28028 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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BrafP28028 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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BrafP28028 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BrafP28028 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BrafP28028 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BrafP28028 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BrafP28028 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BrafP28028 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
BrafP28028 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BrafP28028 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BrafP28028 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BrafP28028 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BrafP28028 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BrafP28028 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BrafP28028 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BrafP28028 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BrafP28028 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BrafP28028 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BrafP28028 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BrafP28028 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BrafP28028 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BrafP28028 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BrafP28028 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BrafP28028 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BrafP28028 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BrafP28028 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BrafP28028 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BrafP28028 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BrafP28028 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BrafP28028 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
BrafP28028 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BrafP28028 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BrafP28028 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
BrafP28028 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BrafP28028 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms