Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde6aP27664 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
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Pde6aP27664 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Pde6aP27664 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Pde6aP27664 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms