Protein–RNA interactions for Protein: P27641

Xrcc5, X-ray repair cross-complementing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc5P27641 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc5P27641 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc5P27641 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc5P27641 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc5P27641 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc5P27641 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc5P27641 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc5P27641 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc5P27641 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc5P27641 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc5P27641 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc5P27641 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc5P27641 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc5P27641 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc5P27641 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Xrcc5P27641 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc5P27641 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc5P27641 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc5P27641 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc5P27641 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc5P27641 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc5P27641 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc5P27641 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Xrcc5P27641 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Xrcc5P27641 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc5P27641 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc5P27641 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc5P27641 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc5P27641 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc5P27641 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc5P27641 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc5P27641 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc5P27641 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc5P27641 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc5P27641 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc5P27641 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc5P27641 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc5P27641 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc5P27641 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc5P27641 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Xrcc5P27641 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc5P27641 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc5P27641 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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Xrcc5P27641 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc5P27641 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc5P27641 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc5P27641 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc5P27641 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc5P27641 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc5P27641 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Xrcc5P27641 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Xrcc5P27641 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xrcc5P27641 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xrcc5P27641 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xrcc5P27641 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Xrcc5P27641 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Xrcc5P27641 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xrcc5P27641 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xrcc5P27641 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xrcc5P27641 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Xrcc5P27641 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xrcc5P27641 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xrcc5P27641 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xrcc5P27641 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xrcc5P27641 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xrcc5P27641 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xrcc5P27641 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xrcc5P27641 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xrcc5P27641 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xrcc5P27641 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xrcc5P27641 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xrcc5P27641 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Xrcc5P27641 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xrcc5P27641 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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Xrcc5P27641 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Xrcc5P27641 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xrcc5P27641 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Xrcc5P27641 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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