Protein–RNA interactions for Protein: P25425

Pou2f1, POU domain, class 2, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou2f1P25425 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pou2f1P25425 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pou2f1P25425 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pou2f1P25425 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pou2f1P25425 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pou2f1P25425 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pou2f1P25425 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pou2f1P25425 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Pou2f1P25425 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Pou2f1P25425 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pou2f1P25425 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Pou2f1P25425 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Pou2f1P25425 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Pou2f1P25425 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pou2f1P25425 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pou2f1P25425 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pou2f1P25425 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pou2f1P25425 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pou2f1P25425 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pou2f1P25425 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pou2f1P25425 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pou2f1P25425 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pou2f1P25425 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pou2f1P25425 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pou2f1P25425 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pou2f1P25425 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pou2f1P25425 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pou2f1P25425 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pou2f1P25425 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pou2f1P25425 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pou2f1P25425 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pou2f1P25425 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pou2f1P25425 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou2f1P25425 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou2f1P25425 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou2f1P25425 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou2f1P25425 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou2f1P25425 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou2f1P25425 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou2f1P25425 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou2f1P25425 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou2f1P25425 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou2f1P25425 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou2f1P25425 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou2f1P25425 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou2f1P25425 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou2f1P25425 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou2f1P25425 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou2f1P25425 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou2f1P25425 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou2f1P25425 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou2f1P25425 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou2f1P25425 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou2f1P25425 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou2f1P25425 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou2f1P25425 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou2f1P25425 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou2f1P25425 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou2f1P25425 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou2f1P25425 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou2f1P25425 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou2f1P25425 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou2f1P25425 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou2f1P25425 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou2f1P25425 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou2f1P25425 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou2f1P25425 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou2f1P25425 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou2f1P25425 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou2f1P25425 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou2f1P25425 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou2f1P25425 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou2f1P25425 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou2f1P25425 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou2f1P25425 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Pou2f1P25425 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Pou2f1P25425 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Pou2f1P25425 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Pou2f1P25425 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pou2f1P25425 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pou2f1P25425 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Pou2f1P25425 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pou2f1P25425 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pou2f1P25425 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pou2f1P25425 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pou2f1P25425 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pou2f1P25425 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pou2f1P25425 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pou2f1P25425 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pou2f1P25425 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Pou2f1P25425 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pou2f1P25425 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pou2f1P25425 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pou2f1P25425 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pou2f1P25425 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pou2f1P25425 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pou2f1P25425 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pou2f1P25425 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pou2f1P25425 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pou2f1P25425 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms