Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC12.33□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Fcer1aP20489 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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