Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TP20293 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
TP20293 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
TP20293 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TP20293 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TP20293 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TP20293 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TP20293 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TP20293 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TP20293 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TP20293 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TP20293 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TP20293 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TP20293 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TP20293 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TP20293 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TP20293 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
TP20293 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TP20293 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
TP20293 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TP20293 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TP20293 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TP20293 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TP20293 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TP20293 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TP20293 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TP20293 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TP20293 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TP20293 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TP20293 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TP20293 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TP20293 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TP20293 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TP20293 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
TP20293 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
TP20293 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TP20293 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TP20293 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TP20293 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TP20293 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TP20293 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
TP20293 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TP20293 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TP20293 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TP20293 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TP20293 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TP20293 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TP20293 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TP20293 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TP20293 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TP20293 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TP20293 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TP20293 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TP20293 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TP20293 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TP20293 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TP20293 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TP20293 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TP20293 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TP20293 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TP20293 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
TP20293 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TP20293 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TP20293 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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TP20293 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TP20293 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TP20293 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TP20293 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TP20293 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TP20293 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TP20293 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TP20293 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TP20293 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TP20293 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TP20293 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TP20293 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TP20293 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TP20293 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TP20293 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TP20293 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TP20293 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TP20293 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TP20293 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TP20293 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TP20293 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TP20293 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TP20293 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TP20293 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TP20293 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TP20293 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TP20293 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TP20293 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TP20293 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TP20293 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TP20293 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TP20293 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TP20293 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TP20293 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TP20293 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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