Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa1P11477 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa1P11477 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa1P11477 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa1P11477 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa1P11477 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa1P11477 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa1P11477 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa1P11477 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms