Protein–RNA interactions for Protein: O35111

Kcnk3, Potassium channel subfamily K member 3, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnk3O35111 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcnk3O35111 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcnk3O35111 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcnk3O35111 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcnk3O35111 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcnk3O35111 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcnk3O35111 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Kcnk3O35111 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kcnk3O35111 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kcnk3O35111 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kcnk3O35111 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Kcnk3O35111 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kcnk3O35111 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kcnk3O35111 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Kcnk3O35111 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Kcnk3O35111 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kcnk3O35111 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kcnk3O35111 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kcnk3O35111 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kcnk3O35111 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Kcnk3O35111 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kcnk3O35111 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kcnk3O35111 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Kcnk3O35111 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Kcnk3O35111 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms