Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20828J3KMI7 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms