Protein–RNA interactions for Protein: E9Q623

BC051665, cDNA sequence BC051665, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC051665E9Q623 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC051665E9Q623 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
BC051665E9Q623 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC051665E9Q623 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC051665E9Q623 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC051665E9Q623 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC051665E9Q623 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC051665E9Q623 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC051665E9Q623 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC051665E9Q623 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC051665E9Q623 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
BC051665E9Q623 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC051665E9Q623 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC051665E9Q623 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
BC051665E9Q623 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC051665E9Q623 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
BC051665E9Q623 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
BC051665E9Q623 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC051665E9Q623 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
BC051665E9Q623 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
BC051665E9Q623 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC051665E9Q623 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC051665E9Q623 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
BC051665E9Q623 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
BC051665E9Q623 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC051665E9Q623 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC051665E9Q623 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC051665E9Q623 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC051665E9Q623 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC051665E9Q623 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC051665E9Q623 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC051665E9Q623 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC051665E9Q623 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC051665E9Q623 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC051665E9Q623 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
BC051665E9Q623 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC051665E9Q623 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC051665E9Q623 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC051665E9Q623 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC051665E9Q623 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC051665E9Q623 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC051665E9Q623 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC051665E9Q623 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC051665E9Q623 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC051665E9Q623 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC051665E9Q623 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC051665E9Q623 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC051665E9Q623 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC051665E9Q623 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
BC051665E9Q623 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
BC051665E9Q623 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC051665E9Q623 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC051665E9Q623 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
BC051665E9Q623 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
BC051665E9Q623 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC051665E9Q623 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC051665E9Q623 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC051665E9Q623 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC051665E9Q623 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
BC051665E9Q623 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC051665E9Q623 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC051665E9Q623 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC051665E9Q623 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC051665E9Q623 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC051665E9Q623 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC051665E9Q623 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC051665E9Q623 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC051665E9Q623 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC051665E9Q623 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC051665E9Q623 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC051665E9Q623 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC051665E9Q623 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC051665E9Q623 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC051665E9Q623 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC051665E9Q623 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC051665E9Q623 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC051665E9Q623 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC051665E9Q623 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC051665E9Q623 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
BC051665E9Q623 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC051665E9Q623 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC051665E9Q623 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC051665E9Q623 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC051665E9Q623 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC051665E9Q623 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC051665E9Q623 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC051665E9Q623 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC051665E9Q623 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC051665E9Q623 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC051665E9Q623 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC051665E9Q623 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC051665E9Q623 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC051665E9Q623 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC051665E9Q623 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC051665E9Q623 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC051665E9Q623 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC051665E9Q623 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC051665E9Q623 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC051665E9Q623 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
BC051665E9Q623 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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