Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Stxbp4-203ENSMUST00000107875 1660 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Gm28651-201ENSMUST00000185335 644 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 2010109A12Rik-201ENSMUST00000031330 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Gm15498-201ENSMUST00000126693 723 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Gm2474-201ENSMUST00000195162 559 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Gm19228-201ENSMUST00000214030 717 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Gm13171-201ENSMUST00000117233 391 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Ebi3-201ENSMUST00000003274 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Gm25394-201ENSMUST00000157338 133 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Fthl17e-201ENSMUST00000096509 841 ntAPPRIS P1 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms