Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brpf3B2KF05 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Brpf3B2KF05 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms