Protein–RNA interactions for Protein: A3KMN5

Prr16, Protein Largen, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr16A3KMN5 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prr16A3KMN5 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms