Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB16

Cab39l, Calcium-binding protein 39-like, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39lQ9DB16 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cab39lQ9DB16 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cab39lQ9DB16 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cab39lQ9DB16 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cab39lQ9DB16 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cab39lQ9DB16 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cab39lQ9DB16 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cab39lQ9DB16 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cab39lQ9DB16 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cab39lQ9DB16 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cab39lQ9DB16 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cab39lQ9DB16 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cab39lQ9DB16 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cab39lQ9DB16 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cab39lQ9DB16 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cab39lQ9DB16 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cab39lQ9DB16 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cab39lQ9DB16 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cab39lQ9DB16 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cab39lQ9DB16 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cab39lQ9DB16 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cab39lQ9DB16 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cab39lQ9DB16 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cab39lQ9DB16 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cab39lQ9DB16 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cab39lQ9DB16 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cab39lQ9DB16 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cab39lQ9DB16 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cab39lQ9DB16 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cab39lQ9DB16 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cab39lQ9DB16 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cab39lQ9DB16 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cab39lQ9DB16 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cab39lQ9DB16 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cab39lQ9DB16 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cab39lQ9DB16 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cab39lQ9DB16 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cab39lQ9DB16 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cab39lQ9DB16 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cab39lQ9DB16 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cab39lQ9DB16 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cab39lQ9DB16 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cab39lQ9DB16 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cab39lQ9DB16 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cab39lQ9DB16 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cab39lQ9DB16 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cab39lQ9DB16 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cab39lQ9DB16 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cab39lQ9DB16 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cab39lQ9DB16 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cab39lQ9DB16 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cab39lQ9DB16 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cab39lQ9DB16 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cab39lQ9DB16 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cab39lQ9DB16 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cab39lQ9DB16 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cab39lQ9DB16 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cab39lQ9DB16 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cab39lQ9DB16 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cab39lQ9DB16 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cab39lQ9DB16 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cab39lQ9DB16 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cab39lQ9DB16 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cab39lQ9DB16 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cab39lQ9DB16 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cab39lQ9DB16 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cab39lQ9DB16 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cab39lQ9DB16 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cab39lQ9DB16 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cab39lQ9DB16 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cab39lQ9DB16 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cab39lQ9DB16 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cab39lQ9DB16 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cab39lQ9DB16 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cab39lQ9DB16 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cab39lQ9DB16 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cab39lQ9DB16 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cab39lQ9DB16 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cab39lQ9DB16 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cab39lQ9DB16 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cab39lQ9DB16 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cab39lQ9DB16 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cab39lQ9DB16 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cab39lQ9DB16 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cab39lQ9DB16 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cab39lQ9DB16 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cab39lQ9DB16 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cab39lQ9DB16 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cab39lQ9DB16 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cab39lQ9DB16 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cab39lQ9DB16 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cab39lQ9DB16 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cab39lQ9DB16 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cab39lQ9DB16 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cab39lQ9DB16 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cab39lQ9DB16 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cab39lQ9DB16 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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