Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7M8

Polr2d, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2dQ9D7M8 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2dQ9D7M8 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2dQ9D7M8 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2dQ9D7M8 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2dQ9D7M8 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2dQ9D7M8 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2dQ9D7M8 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2dQ9D7M8 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2dQ9D7M8 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2dQ9D7M8 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2dQ9D7M8 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2dQ9D7M8 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2dQ9D7M8 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2dQ9D7M8 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2dQ9D7M8 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2dQ9D7M8 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2dQ9D7M8 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2dQ9D7M8 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2dQ9D7M8 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2dQ9D7M8 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2dQ9D7M8 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2dQ9D7M8 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2dQ9D7M8 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2dQ9D7M8 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2dQ9D7M8 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2dQ9D7M8 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2dQ9D7M8 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2dQ9D7M8 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2dQ9D7M8 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2dQ9D7M8 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr2dQ9D7M8 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2dQ9D7M8 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2dQ9D7M8 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2dQ9D7M8 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2dQ9D7M8 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2dQ9D7M8 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2dQ9D7M8 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2dQ9D7M8 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2dQ9D7M8 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2dQ9D7M8 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2dQ9D7M8 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2dQ9D7M8 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2dQ9D7M8 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2dQ9D7M8 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2dQ9D7M8 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2dQ9D7M8 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2dQ9D7M8 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2dQ9D7M8 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2dQ9D7M8 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2dQ9D7M8 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2dQ9D7M8 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2dQ9D7M8 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2dQ9D7M8 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2dQ9D7M8 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2dQ9D7M8 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2dQ9D7M8 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2dQ9D7M8 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2dQ9D7M8 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2dQ9D7M8 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2dQ9D7M8 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2dQ9D7M8 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr2dQ9D7M8 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2dQ9D7M8 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2dQ9D7M8 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2dQ9D7M8 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2dQ9D7M8 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2dQ9D7M8 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2dQ9D7M8 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2dQ9D7M8 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2dQ9D7M8 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2dQ9D7M8 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2dQ9D7M8 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2dQ9D7M8 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2dQ9D7M8 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2dQ9D7M8 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2dQ9D7M8 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2dQ9D7M8 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2dQ9D7M8 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2dQ9D7M8 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2dQ9D7M8 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2dQ9D7M8 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2dQ9D7M8 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2dQ9D7M8 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2dQ9D7M8 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2dQ9D7M8 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2dQ9D7M8 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2dQ9D7M8 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2dQ9D7M8 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2dQ9D7M8 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Polr2dQ9D7M8 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Polr2dQ9D7M8 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Polr2dQ9D7M8 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Polr2dQ9D7M8 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2dQ9D7M8 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2dQ9D7M8 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2dQ9D7M8 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2dQ9D7M8 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2dQ9D7M8 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2dQ9D7M8 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2dQ9D7M8 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms