Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtf2e1Q9D0D5 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms