Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RpainQ9CWY9 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
RpainQ9CWY9 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RpainQ9CWY9 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RpainQ9CWY9 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RpainQ9CWY9 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RpainQ9CWY9 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RpainQ9CWY9 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RpainQ9CWY9 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RpainQ9CWY9 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RpainQ9CWY9 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RpainQ9CWY9 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RpainQ9CWY9 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RpainQ9CWY9 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RpainQ9CWY9 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RpainQ9CWY9 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
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RpainQ9CWY9 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RpainQ9CWY9 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms