Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Nicn1Q9CQM0 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Nicn1Q9CQM0 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Nicn1Q9CQM0 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Nicn1Q9CQM0 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nicn1Q9CQM0 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
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