Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms