Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBV7

Cops8, COP9 signalosome complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops8Q8VBV7 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cops8Q8VBV7 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cops8Q8VBV7 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cops8Q8VBV7 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cops8Q8VBV7 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cops8Q8VBV7 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cops8Q8VBV7 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cops8Q8VBV7 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cops8Q8VBV7 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cops8Q8VBV7 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cops8Q8VBV7 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cops8Q8VBV7 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cops8Q8VBV7 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cops8Q8VBV7 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cops8Q8VBV7 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cops8Q8VBV7 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cops8Q8VBV7 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cops8Q8VBV7 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cops8Q8VBV7 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cops8Q8VBV7 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cops8Q8VBV7 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cops8Q8VBV7 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cops8Q8VBV7 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cops8Q8VBV7 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cops8Q8VBV7 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cops8Q8VBV7 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cops8Q8VBV7 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cops8Q8VBV7 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cops8Q8VBV7 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cops8Q8VBV7 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cops8Q8VBV7 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cops8Q8VBV7 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cops8Q8VBV7 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cops8Q8VBV7 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cops8Q8VBV7 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cops8Q8VBV7 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cops8Q8VBV7 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cops8Q8VBV7 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cops8Q8VBV7 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cops8Q8VBV7 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cops8Q8VBV7 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cops8Q8VBV7 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cops8Q8VBV7 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cops8Q8VBV7 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cops8Q8VBV7 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cops8Q8VBV7 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cops8Q8VBV7 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cops8Q8VBV7 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cops8Q8VBV7 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cops8Q8VBV7 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cops8Q8VBV7 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cops8Q8VBV7 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cops8Q8VBV7 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cops8Q8VBV7 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cops8Q8VBV7 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cops8Q8VBV7 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cops8Q8VBV7 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cops8Q8VBV7 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Cops8Q8VBV7 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cops8Q8VBV7 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Cops8Q8VBV7 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cops8Q8VBV7 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cops8Q8VBV7 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cops8Q8VBV7 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cops8Q8VBV7 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cops8Q8VBV7 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cops8Q8VBV7 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cops8Q8VBV7 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cops8Q8VBV7 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cops8Q8VBV7 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cops8Q8VBV7 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cops8Q8VBV7 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cops8Q8VBV7 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cops8Q8VBV7 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cops8Q8VBV7 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cops8Q8VBV7 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cops8Q8VBV7 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cops8Q8VBV7 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cops8Q8VBV7 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cops8Q8VBV7 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cops8Q8VBV7 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cops8Q8VBV7 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cops8Q8VBV7 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cops8Q8VBV7 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cops8Q8VBV7 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cops8Q8VBV7 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cops8Q8VBV7 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cops8Q8VBV7 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cops8Q8VBV7 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms