Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc12Q8K2L8 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms