Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ8

Cracr2b, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2bQ80ZJ8 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cracr2bQ80ZJ8 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cracr2bQ80ZJ8 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cracr2bQ80ZJ8 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cracr2bQ80ZJ8 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cracr2bQ80ZJ8 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cracr2bQ80ZJ8 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cracr2bQ80ZJ8 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cracr2bQ80ZJ8 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cracr2bQ80ZJ8 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cracr2bQ80ZJ8 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cracr2bQ80ZJ8 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cracr2bQ80ZJ8 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cracr2bQ80ZJ8 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cracr2bQ80ZJ8 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cracr2bQ80ZJ8 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cracr2bQ80ZJ8 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cracr2bQ80ZJ8 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cracr2bQ80ZJ8 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cracr2bQ80ZJ8 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cracr2bQ80ZJ8 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cracr2bQ80ZJ8 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cracr2bQ80ZJ8 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cracr2bQ80ZJ8 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cracr2bQ80ZJ8 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cracr2bQ80ZJ8 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cracr2bQ80ZJ8 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cracr2bQ80ZJ8 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cracr2bQ80ZJ8 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cracr2bQ80ZJ8 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cracr2bQ80ZJ8 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cracr2bQ80ZJ8 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cracr2bQ80ZJ8 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cracr2bQ80ZJ8 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cracr2bQ80ZJ8 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cracr2bQ80ZJ8 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cracr2bQ80ZJ8 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cracr2bQ80ZJ8 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cracr2bQ80ZJ8 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cracr2bQ80ZJ8 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cracr2bQ80ZJ8 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cracr2bQ80ZJ8 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cracr2bQ80ZJ8 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Cracr2bQ80ZJ8 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Cracr2bQ80ZJ8 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cracr2bQ80ZJ8 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cracr2bQ80ZJ8 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cracr2bQ80ZJ8 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cracr2bQ80ZJ8 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cracr2bQ80ZJ8 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cracr2bQ80ZJ8 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cracr2bQ80ZJ8 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cracr2bQ80ZJ8 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cracr2bQ80ZJ8 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cracr2bQ80ZJ8 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cracr2bQ80ZJ8 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cracr2bQ80ZJ8 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cracr2bQ80ZJ8 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cracr2bQ80ZJ8 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cracr2bQ80ZJ8 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cracr2bQ80ZJ8 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cracr2bQ80ZJ8 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cracr2bQ80ZJ8 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cracr2bQ80ZJ8 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cracr2bQ80ZJ8 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cracr2bQ80ZJ8 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cracr2bQ80ZJ8 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cracr2bQ80ZJ8 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cracr2bQ80ZJ8 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cracr2bQ80ZJ8 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cracr2bQ80ZJ8 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cracr2bQ80ZJ8 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cracr2bQ80ZJ8 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cracr2bQ80ZJ8 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cracr2bQ80ZJ8 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cracr2bQ80ZJ8 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cracr2bQ80ZJ8 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cracr2bQ80ZJ8 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cracr2bQ80ZJ8 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cracr2bQ80ZJ8 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cracr2bQ80ZJ8 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cracr2bQ80ZJ8 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cracr2bQ80ZJ8 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cracr2bQ80ZJ8 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cracr2bQ80ZJ8 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cracr2bQ80ZJ8 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cracr2bQ80ZJ8 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cracr2bQ80ZJ8 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cracr2bQ80ZJ8 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cracr2bQ80ZJ8 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cracr2bQ80ZJ8 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cracr2bQ80ZJ8 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cracr2bQ80ZJ8 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cracr2bQ80ZJ8 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cracr2bQ80ZJ8 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cracr2bQ80ZJ8 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cracr2bQ80ZJ8 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cracr2bQ80ZJ8 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cracr2bQ80ZJ8 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cracr2bQ80ZJ8 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms