Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ccdc88cQ6VGS5 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ccdc88cQ6VGS5 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Ccdc88cQ6VGS5 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Ccdc88cQ6VGS5 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Ccdc88cQ6VGS5 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Ccdc88cQ6VGS5 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Ccdc88cQ6VGS5 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Ccdc88cQ6VGS5 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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Ccdc88cQ6VGS5 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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