Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Usp49Q6P9L4 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Usp49Q6P9L4 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Usp49Q6P9L4 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp49Q6P9L4 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Usp49Q6P9L4 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Usp49Q6P9L4 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Usp49Q6P9L4 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Usp49Q6P9L4 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Usp49Q6P9L4 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Usp49Q6P9L4 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Usp49Q6P9L4 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Usp49Q6P9L4 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Usp49Q6P9L4 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Usp49Q6P9L4 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Usp49Q6P9L4 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp49Q6P9L4 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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Usp49Q6P9L4 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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