Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg9bQ6EBV9 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg9bQ6EBV9 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg9bQ6EBV9 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg9bQ6EBV9 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg9bQ6EBV9 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg9bQ6EBV9 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg9bQ6EBV9 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Atg9bQ6EBV9 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg9bQ6EBV9 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg9bQ6EBV9 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg9bQ6EBV9 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg9bQ6EBV9 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg9bQ6EBV9 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg9bQ6EBV9 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg9bQ6EBV9 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg9bQ6EBV9 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Atg9bQ6EBV9 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Atg9bQ6EBV9 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Atg9bQ6EBV9 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Atg9bQ6EBV9 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Atg9bQ6EBV9 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg9bQ6EBV9 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg9bQ6EBV9 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg9bQ6EBV9 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg9bQ6EBV9 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Atg9bQ6EBV9 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg9bQ6EBV9 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg9bQ6EBV9 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Atg9bQ6EBV9 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg9bQ6EBV9 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg9bQ6EBV9 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg9bQ6EBV9 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Atg9bQ6EBV9 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg9bQ6EBV9 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Atg9bQ6EBV9 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg9bQ6EBV9 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg9bQ6EBV9 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg9bQ6EBV9 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg9bQ6EBV9 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg9bQ6EBV9 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg9bQ6EBV9 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg9bQ6EBV9 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg9bQ6EBV9 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg9bQ6EBV9 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg9bQ6EBV9 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg9bQ6EBV9 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg9bQ6EBV9 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg9bQ6EBV9 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg9bQ6EBV9 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg9bQ6EBV9 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg9bQ6EBV9 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg9bQ6EBV9 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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