Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sbno1Q689Z5 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sbno1Q689Z5 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sbno1Q689Z5 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sbno1Q689Z5 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sbno1Q689Z5 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sbno1Q689Z5 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sbno1Q689Z5 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sbno1Q689Z5 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sbno1Q689Z5 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sbno1Q689Z5 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sbno1Q689Z5 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Sbno1Q689Z5 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Sbno1Q689Z5 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Sbno1Q689Z5 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Sbno1Q689Z5 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sbno1Q689Z5 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Sbno1Q689Z5 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sbno1Q689Z5 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sbno1Q689Z5 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sbno1Q689Z5 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sbno1Q689Z5 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sbno1Q689Z5 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Sbno1Q689Z5 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sbno1Q689Z5 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Sbno1Q689Z5 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sbno1Q689Z5 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sbno1Q689Z5 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sbno1Q689Z5 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sbno1Q689Z5 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Sbno1Q689Z5 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Sbno1Q689Z5 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
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Sbno1Q689Z5 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sbno1Q689Z5 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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