Protein–RNA interactions for Protein: Q61539

Esrrb, Steroid hormone receptor ERR2, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EsrrbQ61539 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EsrrbQ61539 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EsrrbQ61539 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EsrrbQ61539 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EsrrbQ61539 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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EsrrbQ61539 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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EsrrbQ61539 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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EsrrbQ61539 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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EsrrbQ61539 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EsrrbQ61539 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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EsrrbQ61539 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EsrrbQ61539 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EsrrbQ61539 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EsrrbQ61539 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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EsrrbQ61539 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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EsrrbQ61539 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EsrrbQ61539 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EsrrbQ61539 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EsrrbQ61539 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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EsrrbQ61539 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EsrrbQ61539 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EsrrbQ61539 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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EsrrbQ61539 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EsrrbQ61539 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EsrrbQ61539 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EsrrbQ61539 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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EsrrbQ61539 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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EsrrbQ61539 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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EsrrbQ61539 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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EsrrbQ61539 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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EsrrbQ61539 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EsrrbQ61539 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EsrrbQ61539 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EsrrbQ61539 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EsrrbQ61539 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EsrrbQ61539 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EsrrbQ61539 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EsrrbQ61539 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EsrrbQ61539 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EsrrbQ61539 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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EsrrbQ61539 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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