Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp13a3Q5XF89 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms