Protein–RNA interactions for Protein: Q5RIS0

Gm11487, Novel protein, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11487Q5RIS0 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Gm11487Q5RIS0 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm11487Q5RIS0 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm11487Q5RIS0 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm11487Q5RIS0 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm11487Q5RIS0 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Gm11487Q5RIS0 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm11487Q5RIS0 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm11487Q5RIS0 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Gm11487Q5RIS0 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Gm11487Q5RIS0 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Gm11487Q5RIS0 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Gm11487Q5RIS0 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Gm11487Q5RIS0 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm11487Q5RIS0 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Gm11487Q5RIS0 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm11487Q5RIS0 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm11487Q5RIS0 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm11487Q5RIS0 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm11487Q5RIS0 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm11487Q5RIS0 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm11487Q5RIS0 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Gm11487Q5RIS0 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Gm11487Q5RIS0 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Gm11487Q5RIS0 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Gm11487Q5RIS0 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm11487Q5RIS0 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm11487Q5RIS0 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm11487Q5RIS0 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm11487Q5RIS0 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm11487Q5RIS0 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Gm11487Q5RIS0 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Gm11487Q5RIS0 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm11487Q5RIS0 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm11487Q5RIS0 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm11487Q5RIS0 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm11487Q5RIS0 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm11487Q5RIS0 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm11487Q5RIS0 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Gm11487Q5RIS0 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm11487Q5RIS0 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Gm11487Q5RIS0 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm11487Q5RIS0 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm11487Q5RIS0 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm11487Q5RIS0 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm11487Q5RIS0 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm11487Q5RIS0 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm11487Q5RIS0 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm11487Q5RIS0 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm11487Q5RIS0 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm11487Q5RIS0 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm11487Q5RIS0 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm11487Q5RIS0 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm11487Q5RIS0 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11487Q5RIS0 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11487Q5RIS0 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11487Q5RIS0 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11487Q5RIS0 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11487Q5RIS0 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11487Q5RIS0 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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