Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms