Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Fam208bQ5DTT3 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms