Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.6 ms