Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12788-201ENSMUST00000119090 308 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42710-201ENSMUST00000200608 985 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 AL929555.1-201ENSMUST00000215283 509 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 4930599N24Rik-201ENSMUST00000198822 1003 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 5033424D13Rik-201ENSMUST00000221779 648 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
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Gtpbp6Q3U6U5 Spink12-201ENSMUST00000081271 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Vpreb3-201ENSMUST00000000926 625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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Gtpbp6Q3U6U5 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
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Gtpbp6Q3U6U5 Ptma-202ENSMUST00000186255 768 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm40646-201ENSMUST00000218243 490 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms