Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Mterf1a-201ENSMUST00000044746 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Gm28941-201ENSMUST00000185536 1017 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 AC121986.1-201ENSMUST00000218588 781 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 AC152414.2-201ENSMUST00000219620 537 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 CT572999.1-201ENSMUST00000220315 1260 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 AC154838.2-201ENSMUST00000226602 747 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Gm22588-201ENSMUST00000157510 140 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Gm25025-201ENSMUST00000175018 111 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Gm38393-201ENSMUST00000179360 1199 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 4930599A14Rik-201ENSMUST00000186724 387 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Gm43731-201ENSMUST00000196150 666 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Olfr153-201ENSMUST00000217113 1258 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Cox20-201ENSMUST00000027781 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Nme5-201ENSMUST00000079287 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Siah2Q06986 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms