Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Psme1P97371 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Psme1P97371 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Psme1P97371 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Psme1P97371 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Psme1P97371 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Psme1P97371 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Psme1P97371 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Psme1P97371 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Psme1P97371 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Psme1P97371 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Psme1P97371 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Psme1P97371 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Psme1P97371 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Psme1P97371 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Psme1P97371 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Psme1P97371 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Psme1P97371 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Psme1P97371 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Psme1P97371 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Psme1P97371 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Psme1P97371 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Psme1P97371 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Psme1P97371 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Psme1P97371 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Psme1P97371 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Psme1P97371 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Psme1P97371 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Psme1P97371 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Psme1P97371 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Psme1P97371 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Psme1P97371 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Psme1P97371 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Psme1P97371 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Psme1P97371 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Psme1P97371 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Psme1P97371 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Psme1P97371 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Psme1P97371 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Psme1P97371 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Psme1P97371 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Psme1P97371 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Psme1P97371 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Psme1P97371 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Psme1P97371 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psme1P97371 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psme1P97371 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psme1P97371 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psme1P97371 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psme1P97371 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psme1P97371 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psme1P97371 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psme1P97371 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Psme1P97371 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psme1P97371 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psme1P97371 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psme1P97371 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Psme1P97371 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Psme1P97371 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psme1P97371 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psme1P97371 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psme1P97371 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psme1P97371 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psme1P97371 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psme1P97371 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psme1P97371 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psme1P97371 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Psme1P97371 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psme1P97371 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psme1P97371 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psme1P97371 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psme1P97371 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psme1P97371 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psme1P97371 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psme1P97371 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psme1P97371 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psme1P97371 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psme1P97371 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psme1P97371 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psme1P97371 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Psme1P97371 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psme1P97371 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psme1P97371 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psme1P97371 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psme1P97371 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psme1P97371 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psme1P97371 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psme1P97371 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psme1P97371 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psme1P97371 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psme1P97371 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Psme1P97371 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Psme1P97371 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Psme1P97371 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Psme1P97371 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psme1P97371 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psme1P97371 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psme1P97371 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psme1P97371 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psme1P97371 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms